El Fondo Nacional de Desarrollo Integral (FONADIN) fue creado en el marco de la política estatal orientada a promover el desarrollo integral y sostenible de las regiones productivas del país, particularmente aquellas vinculadas a la producción de la hoja de coca y a la diversificación económica de las comunidades rurales.Sus antecedentes se basan en la Ley Nº 1008 Régimen de la Coca y Sustancias Controladas, de 19 de julio de 1988, reglamentada por el Decreto Supremo Nº 22099, de 28 de diciembre de 1988, que estableció la necesidad de contar con instrumentos para promover alternativas al cultivo excedentario de coca. En este contexto se creó el Fondo Nacional de Desarrollo Alternativo (FONADAL), orientado a implementar programas y proyectos de desarrollo en los Yungas de La Paz, el Trópico de Cochabamba y otras zonas productoras.
Posteriormente, la política pública boliviana avanzó hacia un modelo de desarrollo integral, consolidándose con la promulgación de la Ley Nº 144 Revolución Productiva Comunitaria Agropecuaria, de 26 de junio de 2011, y principalmente con la Ley Nº 906 General de la Coca, de 8 de marzo de 2017, que reconoce la importancia cultural, económica y social de la coca, promoviendo al mismo tiempo alternativas sostenibles de desarrollo. Esta norma dispuso la sustitución del FONADAL por el FONADIN, bajo dependencia del Ministerio de Desarrollo Rural y Tierras (MDRyT).
El Decreto Supremo Nº 3204, de 7 de junio de 2017, reglamentó la naturaleza jurídica, finalidades y funciones del FONADIN, estableciéndolo como una institución pública desconcentrada del MDRyT, con independencia administrativa, financiera, legal y técnica, e instruyendo su aplicación a partir del 1 de agosto de 2017. Asimismo, el Decreto Supremo Nº 3318, de 6 de septiembre de 2017, reglamentó la Ley Nº 906, definiendo que el MDRyT, a través del Viceministerio de Coca y Desarrollo Integral (VCDI) y del FONADIN, es responsable de la estrategia nacional para el desarrollo integral sustentable de las regiones productoras de coca.
En este marco, el FONADIN implementa programas y proyectos en el ámbito del Programa de Apoyo a la Política Sectorial para la Estrategia Nacional de Desarrollo Integral con Coca (PAPS II) y del Programa de Apoyo a la Política Sectorial en Seguridad Alimentaria (APSSA), priorizando el desarrollo productivo, la seguridad alimentaria, la resiliencia al cambio climático, el acceso a servicios
En fecha 6 de diciembre de 2021, se suscribió el Convenio de Financiamiento Nº DCI – ALA/2023-038/966, entre la Comunidad Europea y el Estado Plurinacional de Bolivia, con la finalidad de financiar el “Programa de Apoyo a la Política Sectorial para implementar la Estrategia de Desarrollo Integral Sustentable con Coca (PAPS III)”, que establece que el Ministerio de Desarrollo Rural y Tierras, mediante el Viceministerio de Coca y Desarrollo Integral, se constituye como beneficiario directo del convenio de financiación, y el FONADIN se constituye en el brazo operativo para la ejecución e implementación del convenio, considerando la capacidad y experiencia institucional especifica en la temática de Desarrollo Integral; el cual, está orientado a la implementación de la “Estrategia de Desarrollo Integral Sustentable con Coca 2021 – 2025” (EDISC).
Por ello se puede decir, que el FONADIN constituye un instrumento estratégico del MDRyT, cuya misión y visión se articulan con el Plan de Desarrollo Económico y Social (PDES), orientando sus acciones al fortalecimiento de la economía comunitaria, la protección de los recursos naturales y la consolidación de un desarrollo integral, participativo y sostenible.